Euroopan komissio on valinnut ohjelmakaudelle 2021-2027 viisi politiikkatavoitetta ja kaksi Interreg-spesifiä tavoitetta. Ohjelmaan voidaan valita korkeintaan kolme politiikkatavoitetta ja yksi Interreg-spesifi tavoite.
Kesällä 2020 toteutetun kyselyn ja syyskuussa 2020 järjestettyjen alueellisten sidosryhmätilaisuuksien tulosten perusteella Karelia-ohjelman ohjelmointikomitea valitsi jatkoon seuraavat tavoitteet:
- Älykkäämpi yhteistyöalue
- Vihreämpi yhteistyöalue
- Lähempänä kansalaisia oleva yhteistyöalue
- Parempi yhteistyön hallinta
